Cell | 建立人类神经纤维状细胞与辅助性T细胞相互作用模型

2022-02-14 11:54:43 来源:
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线粒本体-线粒本体相互起着异常繁复,涵盖大量分子可与接收器通路,史学界研习多年,仍旧是管中窥豹。来自法国巴黎PSL学术研究大学的Vassili Soumelis的团队于在Cell杂志上发表题为A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的文章,组织起来了科学学术研究与假说相结合的学术研究法则,科学学术研究上,在蛋白质高水平验证了线粒本体所分泌物的巨噬线粒本体与应激反应;假说上,组织起来了接收器输入输出新错综繁复的联系和相互起着的关系。所作以人类锥状状线粒本体(Dendritic cell,前身DC)与辅助性T线粒本体(T Helper cell,前身Th)错综繁复的相互起着为学术研究对象,分析了36例DC系统性的接收器分子可和17种Th分泌物的巨噬线粒本体,并依靠这些统计数据组织起来数学框架,演算出新56种现在被科学学术研究属实的线粒本体相互的关系,与此同时,还推测出新290种可能的关系,并属实了IL-12p70可以通过IL-1接收器通路作用于17标准型辅助性T线粒本体(前身Th17)。首先,所作野外了人类单核线粒本体来源的DC(MoDCs)和肺脏血清CD11c+DC(bDCs)两类线粒本体,并作用于24小时。所换用的作用于接收器主要包含三大类共约14种。第一种:内源接收器分子可,还包括趋化因子beta(interferon β,前身IFN-β),GM-CSF, TSLP和 PGE2;第二种:Toll都为蛋白的络合物,还包括Toll4蛋白的选择性脂多糖( lipopolysaccharide,前身LPS),Toll1/2蛋白选择性PAM3CSK4,Dectin1选择性Curdlan,Toll2/Dectin1选择性 zymosan,Toll7/8蛋白选择性R848,Toll3蛋白选择性 poly(I:C) 和NLRP3炎症小本体活化剂铝钾;第三种:细菌病毒,还包括高温灭活的Candida albicans (前身HKCA),李斯特菌(Listeria monocytogenes,前身HKLM),Staphylococcus aureus (前身HKSA), Streptococcus pneumoniae (前身HKSP)和流感病毒(influenza virus,前身flu)。最后,所作通过流式线粒本体术等法则,验证了36种DC系统性分子可的表达出新来情况,其中,29种位处线粒本体外层,7种位处线粒本体分泌物上清之中。近期,除了一些已确定的DC线粒本体号召基本上,所作还有了一些一新挖掘出:(1)zymosan作用于的MoDCs 表达出新来高层次的CD54 和PVR;(2)流感病毒作用于的MoDCs可以作用于ICOSL;(3)LPS作用于的MoDCs 可以作用于高层次的CD30L和CD83。再下来,所作将这些作用于过的DC与T线粒本体共培养6天,随后验证Th的作用于效率以及17种Th系统性巨噬线粒本体的表达出新来分泌物情况。有趣的是,所作将Th和DC的表现相互尤其,挖掘出,这二者错综繁复十分存在一一对应的的关系,也就是说,两种作用于物对DC归因于的功效类似,但是,这两种作用于物所妥善处理的DC与T线粒本体共培养之后,归因于的功效很可以截然不同。接着,所作换用生物化学的法则,以上述科学学术研究统计数据组织起来框架。简单来说,所作综合DC输出新的36种接收器分子可和Th输出新的17种效应分子可,将两两错综繁复的的关系标准化为“相反转录”和“但球队向转录”两种,并且,还加入统计数据库和已发表文献中的接收者,组织起来了繁复的接收器转录局域网。例如,通过这一框架,所作挖掘出, IL-10的但球队向转录分子可还包括OX40L, 4-1BBL, IL-12, TNF-α, CD58, VISTA,Galectin-3, CD80, CD29, IL-1, ICAM-3, SLAMF3, IL-28a和CD83,而相反转录分子可还包括Jagged-2, PDL1, IL-10, CD11a, HLA-DR, ICOSL, CD100, CD30L, CD18, ICAM-2和CD86,这都为,给予DC不同的作用于接收器,所作就可以推断出新Th号召线粒本体IL-10的表达出新来分泌物情况。之前,所作来进行这都为框架,力图推测并属实一新线粒本体相互的关系。通过组织起来的框架,所作挖掘出,IL-12在与IL-1, ICAM-2或者Jagged-2一同分泌物时,个人主义于转录IL-17F,而与CD70, IL-23或者 LIGHT 一同出新现时,则更个人主义于转录IL-17A。另外,敲除IL-12,IL-17A和IL-17F的表达出新来高水平都值得注意减小。这些结果指明,IL-12投身于Th17的作用于分化。为了必要性论述IL-12作用于Th17的机制,所作换用肾脏作用于Th的框架,挖掘出,IL-12十分能同都为作用于Th17,但是,同时加入IL-1和IL-12,Th17就作用于出新来了。这是一篇科学学术研究与假说相结合的佳作。科学学术研究结果与计算统计数据分析相互支持,相互指导,相辅相成。如下图下图,科学学术研究一小换用了密切关联两一小统计数据,一是何种作用于下DC线粒本体的号召,二是号召后的DC对T线粒本体的起着。假说一小以DC和T线粒本体的输出新巨噬线粒本体为核心,组织起来了巨噬线粒本体错综繁复的相反和但球队向转录局域网框架。通过这一框架,所作预测出新一些一新线粒本体间相互的关系,最终再用科学学术研究属实这些的关系到底属实。这短文的卖点有比邻,一是组织起来和科学学术研究假说相结合学术研究的独创,二是文章中提供的诸多线粒本体转录接收者以供学术研究参考。早期出新处:Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.
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